Oprogramowanie : Avogadro : Avogadro

Avogadro

Przegląd oprogramowania

Główne funkcje

  • Obsługuje wiele różnych formatów plików cząsteczek, takich jak CML, PDB, XYZ i MDL Mol
  • Udostępnia konfigurowalne narzędzia i ustawienia wyświetlania do edycji i wizualizacji cząsteczek
  • Umożliwia instalację dodatkowych funkcji za pomocą wtyczek

Avogadro to edytor molekuł i wizualizator o otwartym kodzie źródłowym. Jest stosowany w modelowaniu molekularnym, chemii obliczeniowej, bioinformatyce, materiałoznawstwie i innych pokrewnych dziedzinach.

Avogadro obsługuje dużą liczbę formatów plików cząsteczek, takich jak CML, HyperChem, MDL Mol, Computational Chemistry Output, PDB i XYZ. Aplikacja oferuje szereg dostosowywanych narzędzi używanych do rysowania, nawigacji, manipulowania, wybierania i automatycznej optymalizacji cząsteczek. Do wizualizacji różnych aspektów cząsteczek można wybierać spośród szeregu typów wyświetlaczy, takich jak wielokąt, rysunek, osie i wiązania wodorowe. Ponadto Avogadro jest rozszerzalny, co pozwala na instalowanie dodatkowych funkcji, takich jak polecenia, narzędzia interaktywne i możliwości renderowania.

Avogadro to imponujący edytor i wizualizator cząsteczek przeznaczony zarówno dla studentów, jak i zaawansowanych badaczy. Program obsługuje różnorodne formaty plików cząsteczek, zapewniając przydatne narzędzia i wyświetlacze do edycji i wizualizacji cząsteczek. Avogadro to doskonały wybór dla użytkowników w dziedzinie modelowania molekularnego, bioinformatyki, inżynierii materiałowej i chemii obliczeniowej.

Zaktualizowano: 19 grudnia 2014 r.

▶ Podstawowe rozszerzenie pliku

.cml – Chemical Markup Language File

▶ Używane inne rozszerzenia plików Avogadro 1

Obsługiwane typy plików
.PDB Protein Data Bank File
.CIF Crystallographic Information File
.XYZ Molecule Specification File
.HIN HyperChem Input File
.MOL MDL Molfile
.NWO NWChem Output File
.SDF Structure Data File
Dodatkowe powiązane formaty plików