.cram Rozszerzenie pliku
Typ pliku Compressed Alignment File
| Twórca | EBI |
| Kategoria | Pliki danych |
| Format | Binary |
Czym są pliki CRAM?
Skompresowany plik formatu wyrównania opracowany przez EBI, europejską siedzibę Europejskiego Laboratorium Biologii Molekularnej; przechowuje krótkie sekwencje odczytów sekwencji DNA generowanych z krótkich czytników, takich jak BWA, BBMap i BLAT.
Format pliku CRAM jest podobny do formatu plików Binary Alignment / Map (BAM), ale ma lepszą kompresję plików i zmieniony binarny format kontenera. Wraz ze wzrostem wolumenów danych w oprogramowaniu genetycznym, format CRAM został zaprojektowany w celu zmniejszenia drukowania danych wyrównania na dysku stopy.
Krótkie czytanie jest procesem rozszyfrowania skąd pochodzi sekwencja w genomie. Może to być trudne, ponieważ genom referencyjny jest raczej duży i nie zawsze szukasz dokładnych dopasowań w genomie referencyjnym. Krótkie czytniki są używane do wyszukiwania ogromnych sekwencji w meczach i meczach w pobliżu. Ponieważ sekwencje są tak duże, kompresja zapewniona przez formaty takie jak CRAM jest niezbędna do utrzymania wielkości plików w zarządzaniu.
| Windows |
|